物流公司内账的做账流程如下：
设置账簿
总账
日记账
三栏式明细账
费用多栏式明细账
数量金额式明细账
编制记账凭证
根据实际发生的经济业务取得原始凭证
根据记账凭证登记明细账
根据科目汇总表登记总账
账务处理
收入：
主营业务收入（如运输费、装卸费、堆存费、代理业务收入等）
确认收入时：借：银行存款（或库存现金、应收账款等），贷：主营业务收入——运输收入（或其他相关收入科目），贷：应交税费——应交增值税（销项税额）
成本：
主营业务成本（包括汽车费、人员工资、外包成本等）
支付运输费时：借：营业费用——运杂费（燃料费），贷：库存现金或银行存款
计提各项税费：借：营业税金及附加——营业税、城建税、教育费附加、地方教育费附加，管理费用——印花税，所得税费用——所得税，贷：应缴税费
费用：
管理费用（如业务招待费、差旅费等）
销售费用（如与提供物流劳务服务相关的包车费用）
支付包车费用时：
借：主营业务成本（运货物用），贷：库存现金或银行存款
借：管理费用——交通费（上下班用），贷：库存现金或银行存款
借：营业费用——交通费（跑业务用），贷：库存现金或银行存款
其他：
应收账款
应付账款
预收账款
银行存款
库存现金
财务报表编制
根据明细账和总账编制财务报表
包括资产负债表、利润表和现金流量表
纳税申报
根据相关税法规定进行增值税、所得税等税种的申报工作
内部控制与审核
严格审核每一笔费用支出，确保其真实性、合理性
定期进行内部审计和结账，确保账目相符
通过以上步骤，物流公司可以规范地进行内账管理，确保财务数据的准确性和合规性。