农业银行存钱会扣钱的原因可能有以下几点：
异地存款手续费 ：如果使用其他银行的卡到农行存钱，或者持异地卡存钱，需要支付一定的手续费。自动扣费业务：
如果开通了手机话费自动充值、保险费缴纳等自动扣费业务，银行会按照设定的金额定期从账户中扣款。
贷款还款：
如果账户中有未归还的贷款，银行会每天扣除相应的贷款还款金额。
存款利息：
如果卡中有存款，银行会按照利率计算存款利息，并每日将利息扣除。
其他费用：
如果账户存在其他费用，例如账户管理费、挂失手续费等，每天都会从卡中扣取相应的费用。
年费和小额账户管理费
年费：农行卡每年会收取10元的年费。
小额账户管理费：如果账户日均余额不足300元，会按每月1元、每季度3元扣取小额账户管理费。
短信通知费：
如果开通了手机短信服务，每月可能会扣除2元左右的服务费用。
恶意扣款：
有时账户可能会被恶意扣款，例如被绑定了流氓软件或未经用户同意的自动代扣费。
为了弄清楚具体扣费原因，建议直接联系农业银行的客服人员，提供银行卡相关信息，查询具体的扣费明细和原因。