自建车库的赔偿方式主要依据当地政府的相关政策和规定。以下是一些可能的赔偿方式：
提供同等价值的新车库或补偿款
政府可能会提供一个新的车库，其价值与被拆迁的自建车库相当，或者提供一笔用于建造新车库的补偿款。
土地补偿款
如果农村未有拆迁商业规划，政府可能会提供土地补偿款，供车主自行购买新的土地用于建设车库。
货币补偿
政府会对车库进行估价，并提供相应的货币补偿款。具体的补偿金额会根据车库的实际价值、区位、用途等因素，以房地产市场评估价格确定。
产权调换
在某些情况下，拆迁人可能会提供与被拆迁车库价值相当的新房屋进行产权调换，需要计算被拆迁车库的补偿金额和所调换房屋的价格，并结清产权调换的差价。
其他补偿
除了上述补偿方式外，还可能包括搬迁补助、临时安置补助、停产停业损失补偿等。
需要注意的是，自建车库若没有获得产权证明，则可能被视为违建建筑，从而无法获得赔偿。即使车库属于合法建筑但没有产权证，其补偿金额也会低于有产权证的车库，并且需要经过房地产管理部门的确认和有关部门的合法性认定。
因此，建议车主在拆迁前与当地政府进行充分沟通，明确补偿政策和标准，以确保自身权益得到合理保障。