值班补贴通常应计入工资总额的一部分。根据相关法规，工资总额由以下六个部分组成：
1. 计时工资
2. 计件工资
3. 奖金
4. 津贴和补贴
5. 加班加点工资
6. 特殊情况下支付的工资
值班补贴作为津贴和补贴的一种形式，应计入工资总额，并在计算个人所得税时包括在内。
会计处理上，企业应根据实际情况将值班补贴计入相应的会计科目，如“管理费用——福利费”或“应付职工薪酬”等。发放值班补贴时，应根据会计准则进行发放，并处理相关的税费。
需要注意的是，不同行业和单位对于值班补贴的具体会计处理可能有所不同，因此在实际操作中应遵循当地法规和会计政策。