土地增值税的预缴方法如下：
预收款方式销售自行开发的房地产项目
应预缴土地增值税 = （预收款 - 应预缴增值税税款） × 土地增值税预征率。
非预收款方式销售自行开发的房地产项目
应预缴土地增值税 = 销售收入 ÷ （1 + 增值税适用税率或者征收率） × 土地增值税预征率。
具体计算步骤：
确定预征率
预征率由各省、自治区、直辖市地方税务局根据当地情况核定。例如，东部地区省份预征率不得低于2%，中部和东北地区省份不得低于1.5%，西部地区省份不得低于1%。
计算预征税款
一般计税方法：应预缴土地增值税 = 预收款 ÷ （1 + 适用税率） × 预征率。
简易计税方法：应预缴土地增值税 = 预收款 ÷ （1 + 征收率） × 预征率。
准备相关材料
确认预缴比例和税额。
准备相关材料如合同、发票、评估报告等。
通过税务系统或实体窗口申报并预缴税款。
保留完税凭证以备查验。
示例计算：
假设一个房产开发企业计划开发5栋住宅楼，2015年年底竣工交付使用，预计收入总额为50000万元。2014年一季度取得的预售收入为10000万元，当地核定的土地增值税预征率为2%：
一般计税方法：
应预缴土地增值税 = 10000万元 ÷ （1 + 9%） × 2% = 10000万元 ÷ 1.09 × 0.02 ≈ 183.49万元。
简易计税方法：
应预缴土地增值税 = 10000万元 ÷ （1 + 5%） × 2% = 10000万元 ÷ 1.05 × 0.02 ≈ 190.48万元。
注意事项：
纳税人应根据适用的计税方法选择合适的计算公式。
预缴土地增值税是开发商在项目竣工前根据预售收入按一定比例缴纳的税款，及时缴纳可避免罚款和纳税风险。
建议咨询当地税务部门，按照政策规定进行交纳，以确保合规性和准确性。