恶意扣押车辆立案时间主要涉及交通事故和非法拘禁两种情况：
交通事故
交通事故中，扣车时间一般不超过十五天，但特殊情况下，经过上级公安机关交通管理部门批准，扣车时间可以延长至六十日。
非法拘禁
非法拘禁罪中，非法扣押车辆如果持续时间超过二十四小时，即构成非法拘禁罪，公安机关应当立案。
结合上述信息，恶意扣押车辆立案时间主要取决于是否构成非法拘禁罪。如果扣押行为持续时间超过二十四小时，则公安机关应当立即立案。在交通事故中，如果扣车时间超过六十日，则也需要立案处理。
建议：
如果车辆被非法扣押且持续时间超过二十四小时，建议立即报警并咨询专业律师以维护自身权益。
在交通事故中，如果扣车时间过长，可以向公安机关交通管理部门或律师咨询相关法律程序，确保自身权益不受侵害。