南京市民缴纳个人所得税可以通过以下几种方式进行：
使用电子税务局或税务APP
登录江苏省的官方网站或税务APP。
选择个人所得税申报模块并填写所得信息。
确认后选择缴税方式并完成支付。
通过扣缴义务人代扣
扣缴义务人（通常是支付所得的单位或个人）负责代扣代缴个人所得税。
行政机关、事业单位实行全员全额扣缴申报，将当期向职工发放的所有工资、津贴、补贴和奖金等收入合并计算应扣缴的个人所得税，并按时向主管税务机关报送相关资料。
直接到税务局缴纳
纳税人可以直接到税务局办理纳税申报和缴纳。
可以选择通过个人三方协议或POS机刷卡等方式缴纳税款。
使用手机APP
南京的纳税人还可以选择使用手机APP进行个税交纳，这些APP通常与税务部门合作，提供便捷的税务服务。
税率和扣除标准
个税起征点是5000元/月。
税率采用超额累进税率，具体税率和速算扣除数如下：
收入达到3500元以上至5000元以下，税率为3%。
收入达到5000元以上至10000元以下，税率为5%。
收入达到10000元以上至20000元以下，税率为10%。
收入达到20000元以上至30000元以下，税率为20%。
收入达到30000元以上至40000元以下，税率为25%。
收入达到40000元以上至60000元以下，税率为30%。
收入达到60000元以上至80000元以下，税率为35%。
收入达到80000元以上，税率为45%。
综合所得和经营所得的计算方法
综合所得：应纳税额 = （工资薪金所得 - “五险一金” - 扣除数）× 适用税率 - 速算扣除数。
经营所得：适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率，具体计算方法类似综合所得。
建议选择上述方式之一进行申报和缴纳，以确保按时足额缴纳税款。如有疑问，可联系税务部门或查询官方网站获取帮助。